Prowadzimy praktyczne szkolenia laboratoryjne dla pracowników laboratoriów i placówek medycznych – od technik pracy z próbkami po procedury i standardy jakości. Stawiamy na praktykę i przykłady z codziennej pracy laboratorium.
Szkolenie: Nowoczesne techniki izolacji kwasów nukleinowych oraz ocena jakościowa i ilościowa materiału genetycznego w diagnostyce laboratoryjnej
Cel szkolenia: Celem szkolenia jest rozwinięcie kompetencji w zakresie świadomego i krytycznego prowadzenia etapu przedanalitycznego i analitycznego badań molekularnych poprzez:
zrozumienie molekularnych podstaw izolacji DNA i RNA,
właściwy dobór metody izolacji do typu materiału klinicznego i celu badania,
ocenę jakości, czystości i integralności izolatu w kontekście dalszych analiz (PCR, RT-PCR, NGS),
poznanie zasad bezpiecznego przechowywania materiału biologicznego i wyizolowanych kwasów nukleinowych oraz ich wpływu na stabilność i powtarzalność wyników,
identyfikację krytycznych punktów kontroli (critical control points) w procedurze laboratoryjnej,
podejmowanie decyzji diagnostycznych na podstawie parametrów jakościowych próbki
Odbiorca: Diagności laboratoryjni, technicy laboratoryjni, pracownicy naukowo-dydaktycznych oraz doktoranci realizujących badania z wykorzystaniem technik izolacji kwasów nukleinowych.
Program:
Część teoretyczna (3 x 45 min):
Etap przedanalityczny jako fundament diagnostyki molekularnej: Od pobrania do ekstrakcji – gdzie najczęściej powstaje błąd, stabilność DNA vs RNA – implikacje praktyczne, transport i przechowywanie materiału do badań.
Chemia izolacji: Liza komórkowa i inaktywacja nukleaz, różnice między metodami: klasyczna, kolumienkowa, magnetyczna, izolacja z materiałów trudnych (FFPE, wymazy, mała objętość próbki)
Kontrola jakości izolatu: spektrofotometria vs fluorometria, interpretacja wskaźników czystości, Integralność DNA i RNA
Przechowywanie i archiwizacja materiału genetycznego: Temperatura i czas – degradacja w praktyce, cykle zamrażanie-rozmrażanie, bankowanie materiału do badań retrospektywnych, stabilność izolatu a powtarzalność badań
Krytyczna analiza przypadków diagnostycznych: niska wydajność izolacji, kontaminacja, niezdolność próbek do analizy.
Część praktyczna (6 x 45 min):
Część warsztatowa obejmuje wykonanie i analizę pełnego procesu przygotowania materiału genetycznego do badań molekularnych:
Izolacja kwasów nukleinowych: Samodzielne przeprowadzenie izolacji DNA i RNA metodą kolumienkową z materiału klinicznego, Automatyczna izolacja DNA, identyfikacja punktów krytycznych procedury.
Ocena ilościowa i jakościowa izolatu: Pomiar stężenia metodą spektrofotometryczną i/lub fluorometryczną, interpretacja wskaźników czystości (A260/A280, A260/A230) oraz ocena integralności materiału metodą elektroforezy.
Zabezpieczenie i przechowywanie materiału genetycznego: Omówienie zasad właściwego przechowywania wyizolowanych kwasów nukleinowych (temperatura, unikanie cykli zamrażanie–rozmrażanie, ochrona przed degradacją), dokumentowanie jakości izolatu oraz ocena przydatności próbki do dalszych badań molekularnych.
Czas trwania szkolenia: 1 dzień: 9:00 – 17:30
Cena: 1000 zł
Miejsce realizacji: Medyczne Laboratorium Diagnostyczne, Pracownia Diagnostyki Laboratoryjnej, Meduniv, Kielce, Al. IX Wieków Kielc 19a, 25-317 Kielce
Minimalna – maksymalna liczba uczestników: 6-10 osób
Szkolenie: Wstęp do reakcji PCR – zasada działania, projektowanie, interpretacja (szkolenie podstawowe)
Cel szkolenia: zapoznanie z zasadą działania standardowej reakcji PCR oraz zaplanowania i przeprowadzenia badania
Odbiorca: uczniowie szkół średnich o profilu biologiczno – chemicznym, studenci kierunków przyrodniczych i medycznych, osoby zainteresowane pracą naukową z wykorzystaniem technik biologii molekularnej, osoby zaczynające pracę w laboratorium genetycznym, mikrobiologicznym, molekularnym, diagnostyki laboratoryjnej
Program:
Część teoretyczna (3 x 45 min):
wstęp do analizy jakościowej i ilościowej DNA z wykorzystaniem techniki łańcuchowej reakcji amplifikacji
mechanizm działania reakcji PCR, zasady projektowania starterów, dobór odczynników i warunków reakcji, skład mieszaniny reakcyjnej, metody optymalizacji, niezbędne wyposażenie laboratorium,
mocne i słabe strony reakcji PCR, problemy w reakcji PCR, zastosowanie,
interpretacja wyników reakcji PCR na wybranych przykładach
Część praktyczna (7 x 45 min):
zapoznanie z niezbędnym wyposażeniem laboratorium i obsługą urządzeń
przygotowanie mieszaniny reakcyjnej oraz ustalenie warunków reakcji
interpretacja wyników reakcji PCR z wykorzystaniem elektroforezy agarozowej lub automatycznej
Czas trwania szkolenia: 9:00 – 17:30
Cena: 1000 zł
Miejsce realizacji: Medyczne Laboratorium Diagnostyczne, Pracownia Diagnostyki Laboratoryjnej, Meduniv, Kielce, Al. IX Wieków Kielc 19a, 25-317 Kielce
Minimalna – maksymalna liczba uczestników: 8 – 10
Szkolenie: Zaawansowane techniki PCR – szkolenie zaawansowane
Cel szkolenia: zapoznanie z technikami wykorzystującymi reakcję łańcuchowej polimeryzacji oraz zastosowanie w diagnostyce i badaniach naukowych
Odbiorca: studenci kierunków przyrodniczych i medycznych, osoby zainteresowane pracą naukową z wykorzystaniem technik biologii molekularnej, osoby zaczynające pracę w laboratorium genetycznym, mikrobiologicznym, molekularnym, diagności laboratoryjni
Program:
Część teoretyczna (6 x 45 min) – 1 dzień:
wstęp do analizy jakościowej i ilościowej DNA z wykorzystaniem technik łańcuchowej reakcji amplifikacji
modyfikacje reakcji PCR: multiplex PCR, PCR-ASO, nested PCR, HRM-PCR, Real Time PCR, RT-PCR – mechanizmy działania, dobór odczynników i warunków reakcji, skład mieszaniny reakcyjnej, metody optymalizacji, niezbędne wyposażenie laboratorium,
mocne i słabe strony reakcji PCR, problemy w reakcji PCR, zastosowanie,
interpretacja wyników reakcji PCR na wybranych przykładach
Część praktyczna (7 x 45 min) – 2 dzień:
zapoznanie z niezbędnym wyposażeniem laboratorium i obsługą urządzeń
przygotowanie mieszaniny reakcyjnej oraz ustalenie warunków reakcji multiplex PCR, HRM-PCR, Real Time-PCR, RT-PCR
interpretacja wyników reakcji PCR z wykorzystaniem elektroforezy agarozowej lub automatycznej
Czas trwania szkolenia: 2 dni: 10:00 – 15:00 (1 dzień), 10:00 – 16:00 (2 dzień)
Cena: 2300 zł
Miejsce realizacji: Medyczne Laboratorium Diagnostyczne, Pracownia Diagnostyki Laboratoryjnej, Meduniv, Kielce, Al. IX Wieków Kielc 19a, 25-317 Kielce
Minimalna – maksymalna liczba uczestników: 8 – 10
Szkolenie: NGS w praktyce – szkolenie zaawansowane
Cel szkolenia: technologia sekwencjonowania NGS w teorii i praktyce
Odbiorca: studenci kierunków przyrodniczych i medycznych, osoby zainteresowane pracą naukową z wykorzystaniem technik biologii molekularnej, osoby zaczynające pracę w laboratorium genetycznym, mikrobiologicznym, molekularnym, diagności laboratoryjni
Program:
Część teoretyczna (4 x 45 min):
wstęp do technologii NGS: mechanizm działania, zaplanowanie badania, oferta rynkowa w Polsce w zakresie aparatury i odczynników
dobór odczynników, analiza protokołu na wybranym przykładzie, metody optymalizacji, niezbędne wyposażenie laboratorium,
mocne i słabe strony NGS, zastosowanie,
interpretacja wyników na wybranych przykładach
Część praktyczna (7 x 45 min):
zapoznanie z niezbędnym wyposażeniem laboratorium i obsługą urządzeń
przygotowanie materiału do badania: analiza jakościowa i ilościowa DNA, przygotowanie biblioteki, normalizacja, denaturacja i poolowanie
instruktaż obsługi sekwenatora i warunków sekwencjonowania
Czas trwania szkolenia: 2 dni: 10:00 – 15:00 (1 dzień), 10:00 – 16:00 (2 dzień)
Cena: 3000 zł (2 dni) (2000 zł – 1 dzień)
Miejsce realizacji: Medyczne Laboratorium Diagnostyczne, Pracownia Diagnostyki Laboratoryjnej, Meduniv, Kielce, Al. IX Wieków Kielc 19a, 25-317 Kielce
Minimalna – maksymalna liczba uczestników: 8 – 10
Szkolenie: Podstawy analizy danych NGS z elementami Linux
Cel szkolenia: Celem kursu jest wyposażenie uczestników w umiejętności poruszania się w środowisku CLI (Command Line Interface) oraz przeprowadzenie kompletnego procesu analizy danych (pipeline) – od surowych odczytów z sekwenatora po identyfikację wariantów genetycznych.
Odbiorca: Kurs skierowany jest do biologów, diagnostów oraz pracowników laboratoriów genetycznych, którzy potrzebują technicznej samodzielności w pracy z surowymi danymi NGS.
Program:
Część teoretyczna (4 x 45 min):
Wstęp do bioinformatycznej analizy danych NGS: Omówienie metod sekwencjonowania, omówienie architektury systemów Linux, rola linii komend w przetwarzaniu wysokoprzepustowym oraz specyfika formatów plików surowych (FASTQ).
Standardy kontroli jakości i przygotowania danych: parametry jakościowe odczytów (Phred score), identyfikacja zanieczyszczeń, usuwanie adapterów oraz mechanizmy filtracji danych (trimming i cropping).
Zasady mapowania i identyfikacji wariantów: algorytmy dopasowania odczytów do genomu referencyjnego (BWA, Bowtie2), struktura plików mapowania (SAM/BAM) oraz podstawy statystyczne wykrywania polimorfizmów SNP i InDel.
Analiza i interpretacja wyników: budowa pliku VCF, zasady filtrowania wariantów o niskiej wiarygodności oraz wykorzystanie baz danych do anotacji funkcjonalnej wykrytych zmian.
Część praktyczna (4 x 45 min):
Praca w środowisku Linux: konfiguracja terminala, sprawne poruszanie się w systemie plików, zarządzanie uprawnieniami oraz instalacja narzędzi bioinformatycznych za pomocą menedżerów pakietów (Conda).
Analiza w praktyce: samodzielne przeprowadzenie kontroli jakości (FastQC), czyszczenia danych (fastp) oraz mapowania odczytów do genomu wraz z konwersją i sortowaniem plików wynikowych (Samtools).
Weryfikacja i wizualizacja wariantów: detekcja zmian genetycznych (Samtools, GATK) oraz ich manualna ocena z wykorzystaniem przeglądarki genomowej IGV w celu odróżnienia artefaktów od rzeczywistych wariantów.
Czas trwania szkolenia: 1 dzień: 09:00 – 16:15
Cena: 1100 zł
Miejsce realizacji: Online
Minimalna – maksymalna liczba uczestników: 8 – 20